北京大学人民医院临床试验机构负责组织管理全院的临床试验项目，可开展新药I-IV期临床试验和以注册上市为目的的医疗器械和体外诊断试剂临床试验，承担国家药品监督管理局药物临床试验机构的职能。针对药物临床试验管理，机构不断完善各项管理制度和标准操作规程（SOP），制定了一套严密的质量控制制度，建立了药物临床试验研究的科学管理体系，同时加强对研究者进行GCP相关的培训，充分保障药物临床试验运行的科学性和规范性，保障受试者的权益和安全。
2022年6月，北京大学人民医院临床试验机构独立成为一级医技科室，机构主任封宇飞、副主任饶慧瑛。临床试验机构下设机构办公室、研究型病房以及GCP中心药房。机构办公室负责我院所承接的临床试验项目的管理、试验人员培训和技术指导等工作，现有工作人员3名；研究型病房是医院临床试验和临床研究的平台，现有工作人员7名；GCP中心药房承担我院各专业临床试验用药品的管理工作，现有工作人员4名。
